Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A18Q3C1V0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A18Q3C1V0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A18Q3C1V0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A18Q3C1V0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A18Q3C1V0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A18Q3C1V0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms