Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TWISTNBQ3B726 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TWISTNBQ3B726 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TWISTNBQ3B726 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TWISTNBQ3B726 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TWISTNBQ3B726 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TWISTNBQ3B726 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TWISTNBQ3B726 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TWISTNBQ3B726 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TWISTNBQ3B726 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms