Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGGHGQ32M88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGGHGQ32M88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGGHGQ32M88 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms