Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VMACQ2NL98 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VMACQ2NL98 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VMACQ2NL98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms