Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SPHKAPQ2M3C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
SPHKAPQ2M3C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SPHKAPQ2M3C7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SPHKAPQ2M3C7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SPHKAPQ2M3C7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SPHKAPQ2M3C7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms