Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFIL3Q16649 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFIL3Q16649 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFIL3Q16649 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFIL3Q16649 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFIL3Q16649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFIL3Q16649 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms