Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2Q16621 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2Q16621 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2Q16621 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2Q16621 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2Q16621 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NFE2Q16621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2Q16621 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2Q16621 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFE2Q16621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFE2Q16621 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFE2Q16621 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NFE2Q16621 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFE2Q16621 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2Q16621 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2Q16621 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFE2Q16621 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFE2Q16621 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFE2Q16621 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
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