Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
DDB1Q16531 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
DDB1Q16531 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
DDB1Q16531 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
DDB1Q16531 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
DDB1Q16531 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
DDB1Q16531 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
DDB1Q16531 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
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