Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC6Q16204 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC6Q16204 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC6Q16204 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC6Q16204 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC6Q16204 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC6Q16204 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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