Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIK4Q16099 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIK4Q16099 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIK4Q16099 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIK4Q16099 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIK4Q16099 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIK4Q16099 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK4Q16099 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK4Q16099 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIK4Q16099 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK4Q16099 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIK4Q16099 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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