Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEDD8Q15843 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD8Q15843 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8Q15843 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEDD8Q15843 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEDD8Q15843 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD8Q15843 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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