Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEBPEQ15744 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEBPEQ15744 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEBPEQ15744 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEBPEQ15744 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEBPEQ15744 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEBPEQ15744 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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