Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SF3B3Q15393 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SF3B3Q15393 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SF3B3Q15393 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SF3B3Q15393 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SF3B3Q15393 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SF3B3Q15393 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SF3B3Q15393 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms