Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PSME4Q14997 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PSME4Q14997 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSME4Q14997 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSME4Q14997 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSME4Q14997 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME4Q14997 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME4Q14997 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME4Q14997 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
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