Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C1DQ13901 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1DQ13901 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1DQ13901 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1DQ13901 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1DQ13901 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1DQ13901 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1DQ13901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1DQ13901 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1DQ13901 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1DQ13901 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1DQ13901 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1DQ13901 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1DQ13901 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1DQ13901 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1DQ13901 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1DQ13901 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1DQ13901 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1DQ13901 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1DQ13901 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1DQ13901 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1DQ13901 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1DQ13901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1DQ13901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1DQ13901 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1DQ13901 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1DQ13901 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1DQ13901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1DQ13901 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1DQ13901 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1DQ13901 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1DQ13901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1DQ13901 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1DQ13901 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1DQ13901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1DQ13901 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1DQ13901 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1DQ13901 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1DQ13901 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1DQ13901 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1DQ13901 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1DQ13901 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1DQ13901 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1DQ13901 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1DQ13901 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1DQ13901 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1DQ13901 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1DQ13901 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1DQ13901 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1DQ13901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1DQ13901 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1DQ13901 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1DQ13901 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1DQ13901 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1DQ13901 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1DQ13901 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1DQ13901 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1DQ13901 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1DQ13901 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1DQ13901 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1DQ13901 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1DQ13901 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1DQ13901 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1DQ13901 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1DQ13901 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1DQ13901 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1DQ13901 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1DQ13901 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1DQ13901 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1DQ13901 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1DQ13901 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1DQ13901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1DQ13901 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1DQ13901 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1DQ13901 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1DQ13901 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1DQ13901 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1DQ13901 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1DQ13901 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1DQ13901 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1DQ13901 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1DQ13901 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms