Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSTA3Q13630 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSTA3Q13630 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSTA3Q13630 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSTA3Q13630 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSTA3Q13630 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 631.7 ms