Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB3Q13509 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBB3Q13509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB3Q13509 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB3Q13509 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB3Q13509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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