Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP3AQ13472 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP3AQ13472 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP3AQ13472 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3AQ13472 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP3AQ13472 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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