Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPFIA1Q13136 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA1Q13136 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA1Q13136 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPFIA1Q13136 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA1Q13136 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA1Q13136 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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