Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPS1Q13098 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GPS1Q13098 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPS1Q13098 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPS1Q13098 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPS1Q13098 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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