Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX4Q12846 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STX4Q12846 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STX4Q12846 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX4Q12846 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX4Q12846 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX4Q12846 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STX4Q12846 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX4Q12846 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX4Q12846 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STX4Q12846 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX4Q12846 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX4Q12846 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX4Q12846 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX4Q12846 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX4Q12846 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX4Q12846 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX4Q12846 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX4Q12846 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX4Q12846 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX4Q12846 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX4Q12846 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX4Q12846 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX4Q12846 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX4Q12846 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX4Q12846 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX4Q12846 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STX4Q12846 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX4Q12846 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX4Q12846 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX4Q12846 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX4Q12846 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX4Q12846 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX4Q12846 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX4Q12846 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX4Q12846 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX4Q12846 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX4Q12846 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX4Q12846 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX4Q12846 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX4Q12846 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX4Q12846 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STX4Q12846 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX4Q12846 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX4Q12846 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX4Q12846 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX4Q12846 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX4Q12846 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX4Q12846 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STX4Q12846 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX4Q12846 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STX4Q12846 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX4Q12846 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX4Q12846 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX4Q12846 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STX4Q12846 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX4Q12846 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STX4Q12846 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX4Q12846 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX4Q12846 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX4Q12846 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX4Q12846 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX4Q12846 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX4Q12846 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX4Q12846 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX4Q12846 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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