Protein–RNA interactions for Protein: Q09327

MGAT3, Beta-1,4-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT3Q09327 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MGAT3Q09327 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MGAT3Q09327 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MGAT3Q09327 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MGAT3Q09327 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MGAT3Q09327 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MGAT3Q09327 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MGAT3Q09327 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MGAT3Q09327 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MGAT3Q09327 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms