Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNK2Q07912 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNK2Q07912 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNK2Q07912 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNK2Q07912 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNK2Q07912 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNK2Q07912 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms