Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RUNX1T1Q06455 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUNX1T1Q06455 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX1T1Q06455 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNX1T1Q06455 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms