Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN11Q06124 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN11Q06124 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPN11Q06124 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPN11Q06124 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPN11Q06124 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPN11Q06124 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms