Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 GGA2YHR108W 1758 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 NDE2YDL085W 1638 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 APT2YDR441C 546 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 YNR064CYNR064C 873 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 EAF3YPR023C 1206 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 KEL3YPL263C 1956 nt6.76□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 CSM1YCR086W 573 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 CRC1YOR100C 984 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 HIS3YOR202W 663 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 MSB3YNL293W 1902 nt6.75□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 RPL4BYDR012W 1089 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 RPL4AYBR031W 1089 nt6.74□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 OYE2YHR179W 1203 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 APS2YJR058C 444 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 MAM3YOL060C 2121 nt6.73□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 snR31snR31 225 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 FCP1YMR277W 2199 nt6.71□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 SGF73YGL066W 1974 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 YER137CYER137C 447 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 DDI1YER143W 1287 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 MET13YGL125W 1803 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 UBA4YHR111W 1323 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 KGD2YDR148C 1392 nt6.69□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 RPS14BYJL191W 417 nt6.69□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 ADE2YOR128C 1716 nt6.69□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 YBL111CYBL111C 2004 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 LYS20YDL182W 1287 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 APT1YML022W 564 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 RRT8YOL048C 1029 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 FCY21YER060W 1587 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 BNA3YJL060W 1335 nt6.67□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 SAM3YPL274W 1764 nt6.67□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 TIF3YPR163C 1311 nt6.66□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 CDC13YDL220C 2775 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 YCR087WYCR087W 516 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 YJR114WYJR114W 393 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 YNL140CYNL140C 570 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE4Q04201 RPT5YOR117W 1305 nt6.65□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 AAC3YBR085W 924 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 TPS1YBR126C 1488 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 RPL12BYDR418W 498 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 YSR3YKR053C 1215 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 MET1YKR069W 1782 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 YLR030WYLR030W 792 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 TMA23YMR269W 636 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 HUA1YGR268C 597 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 SBP1YHL034C 885 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 YKR018CYKR018C 2178 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 RSC9YML127W 1746 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 ADE8YDR408C 645 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 YLR279WYLR279W 390 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 MIR1YJR077C 936 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 SWT21YNL187W 1074 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE4Q04201 MRN1YPL184C 1839 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 PAR32YDL173W 888 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 IMO32YGR031W 1029 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 PRY1YJL079C 900 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 OPI3YJR073C 621 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YMR244WYMR244W 1068 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 PPS1YBR276C 2424 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 SNU66YOR308C 1764 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 PRB1YEL060C 1908 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 MSB4YOL112W 1479 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 GNP1YDR508C 1992 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 INM1YHR046C 888 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YJL009WYJL009W 327 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 TSC10YBR265W 963 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 EDC3YEL015W 1656 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 TRR1YDR353W 960 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 GLY1YEL046C 1164 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YJL118WYJL118W 660 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YKL053WYKL053W 375 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 TMS1YDR105C 1422 nt6.54□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 MAL31YBR298C 1845 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 ADH6YMR318C 1083 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 AIM45YPR004C 1035 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 INO1YJL153C 1602 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 LRO1YNR008W 1986 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 ICL2YPR006C 1728 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE4Q04201 RFS1YBR052C 633 nt6.52□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 TGL5YOR081C 2250 nt6.52□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 TOD6YBL054W 1578 nt6.52□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 KTR4YBR199W 1395 nt6.51□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 MEP1YGR121C 1479 nt6.51□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 SEC24YIL109C 2781 nt6.51□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 YOR389WYOR389W 1875 nt6.5□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 SAN1YDR143C 1833 nt6.5□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 BUD31YCR063W 474 nt6.49□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 GNA1YFL017C 480 nt6.48□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 RCF2YNR018W 675 nt6.48□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 PMT1YDL095W 2454 nt6.48□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 SSC1YJR045C 1965 nt6.48□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 PPZ2YDR436W 2133 nt6.47□□□□□ -1.37
CUE4Q04201 RMD8YFR048W 1989 nt6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms