Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF90Q03938 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF90Q03938 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF90Q03938 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF90Q03938 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF90Q03938 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms