Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA1DQ01668 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1DQ01668 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1DQ01668 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1DQ01668 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNA1DQ01668 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1DQ01668 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms