Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTD2P86397 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTD2P86397 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTD2P86397 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTD2P86397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTD2P86397 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTD2P86397 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTD2P86397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTD2P86397 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTD2P86397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTD2P86397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTD2P86397 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTD2P86397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTD2P86397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTD2P86397 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTD2P86397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTD2P86397 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTD2P86397 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTD2P86397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTD2P86397 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTD2P86397 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTD2P86397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTD2P86397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTD2P86397 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTD2P86397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTD2P86397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTD2P86397 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTD2P86397 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTD2P86397 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTD2P86397 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTD2P86397 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTD2P86397 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTD2P86397 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTD2P86397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTD2P86397 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTD2P86397 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTD2P86397 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HTD2P86397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTD2P86397 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HTD2P86397 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTD2P86397 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTD2P86397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTD2P86397 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTD2P86397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTD2P86397 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTD2P86397 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTD2P86397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTD2P86397 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTD2P86397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTD2P86397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HTD2P86397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTD2P86397 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTD2P86397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTD2P86397 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTD2P86397 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTD2P86397 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTD2P86397 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTD2P86397 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTD2P86397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms