Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ELF3P78545 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF3P78545 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF3P78545 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF3P78545 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ELF3P78545 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF3P78545 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF3P78545 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ELF3P78545 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELF3P78545 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ELF3P78545 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF3P78545 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF3P78545 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF3P78545 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ELF3P78545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF3P78545 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF3P78545 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF3P78545 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ELF3P78545 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ELF3P78545 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ELF3P78545 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF3P78545 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ELF3P78545 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELF3P78545 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELF3P78545 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELF3P78545 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELF3P78545 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ELF3P78545 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELF3P78545 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ELF3P78545 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ELF3P78545 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELF3P78545 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELF3P78545 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ELF3P78545 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ELF3P78545 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ELF3P78545 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF3P78545 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF3P78545 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF3P78545 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ELF3P78545 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ELF3P78545 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF3P78545 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ELF3P78545 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF3P78545 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF3P78545 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF3P78545 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ELF3P78545 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELF3P78545 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELF3P78545 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ELF3P78545 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF3P78545 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF3P78545 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF3P78545 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ELF3P78545 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELF3P78545 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELF3P78545 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ELF3P78545 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF3P78545 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF3P78545 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF3P78545 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF3P78545 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ELF3P78545 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF3P78545 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF3P78545 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELF3P78545 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF3P78545 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF3P78545 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF3P78545 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF3P78545 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELF3P78545 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELF3P78545 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF3P78545 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF3P78545 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF3P78545 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF3P78545 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELF3P78545 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELF3P78545 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELF3P78545 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms