Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMC6P62333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMC6P62333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMC6P62333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC6P62333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC6P62333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC6P62333 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC6P62333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms