Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACTR3P61158 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTR3P61158 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTR3P61158 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTR3P61158 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTR3P61158 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms