Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DEFA3P59666 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFA3P59666 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEFA3P59666 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEFA3P59666 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DEFA3P59666 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms