Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PROK1P58294 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROK1P58294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROK1P58294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROK1P58294 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROK1P58294 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PROK1P58294 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROK1P58294 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROK1P58294 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROK1P58294 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PROK1P58294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PROK1P58294 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PROK1P58294 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROK1P58294 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROK1P58294 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROK1P58294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROK1P58294 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PROK1P58294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROK1P58294 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROK1P58294 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PROK1P58294 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PROK1P58294 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROK1P58294 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROK1P58294 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROK1P58294 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PROK1P58294 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PROK1P58294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PROK1P58294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PROK1P58294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PROK1P58294 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PROK1P58294 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PROK1P58294 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PROK1P58294 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PROK1P58294 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PROK1P58294 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PROK1P58294 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROK1P58294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PROK1P58294 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROK1P58294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROK1P58294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROK1P58294 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROK1P58294 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PROK1P58294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PROK1P58294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PROK1P58294 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROK1P58294 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PROK1P58294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROK1P58294 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PROK1P58294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PROK1P58294 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PROK1P58294 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PROK1P58294 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PROK1P58294 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PROK1P58294 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PROK1P58294 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PROK1P58294 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PROK1P58294 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PROK1P58294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PROK1P58294 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PROK1P58294 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PROK1P58294 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PROK1P58294 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PROK1P58294 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PROK1P58294 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PROK1P58294 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PROK1P58294 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PROK1P58294 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PROK1P58294 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PROK1P58294 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PROK1P58294 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PROK1P58294 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms