Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN2P57739 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN2P57739 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN2P57739 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN2P57739 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN2P57739 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN2P57739 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN2P57739 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN2P57739 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN2P57739 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms