Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2BFSP57053 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2BFSP57053 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2BFSP57053 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2BFSP57053 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2BFSP57053 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms