Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RP1P56715 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RP1P56715 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RP1P56715 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RP1P56715 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RP1P56715 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RP1P56715 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RP1P56715 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RP1P56715 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RP1P56715 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RP1P56715 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RP1P56715 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RP1P56715 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RP1P56715 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RP1P56715 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RP1P56715 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RP1P56715 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RP1P56715 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RP1P56715 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RP1P56715 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RP1P56715 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RP1P56715 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RP1P56715 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RP1P56715 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RP1P56715 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RP1P56715 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RP1P56715 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RP1P56715 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RP1P56715 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RP1P56715 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RP1P56715 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RP1P56715 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RP1P56715 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RP1P56715 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RP1P56715 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RP1P56715 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RP1P56715 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RP1P56715 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RP1P56715 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RP1P56715 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RP1P56715 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RP1P56715 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RP1P56715 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RP1P56715 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RP1P56715 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RP1P56715 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RP1P56715 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RP1P56715 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RP1P56715 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RP1P56715 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RP1P56715 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RP1P56715 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RP1P56715 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RP1P56715 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RP1P56715 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RP1P56715 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RP1P56715 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RP1P56715 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RP1P56715 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RP1P56715 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RP1P56715 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RP1P56715 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RP1P56715 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RP1P56715 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RP1P56715 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RP1P56715 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RP1P56715 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RP1P56715 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RP1P56715 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RP1P56715 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RP1P56715 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RP1P56715 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RP1P56715 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RP1P56715 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RP1P56715 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RP1P56715 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RP1P56715 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RP1P56715 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RP1P56715 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RP1P56715 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RP1P56715 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RP1P56715 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RP1P56715 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RP1P56715 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RP1P56715 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RP1P56715 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms