Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLNS1AP54105 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLNS1AP54105 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLNS1AP54105 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLNS1AP54105 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLNS1AP54105 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms