Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABGGTBP53611 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RABGGTBP53611 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABGGTBP53611 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABGGTBP53611 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RABGGTBP53611 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGGTBP53611 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGGTBP53611 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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