Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZA1P52907 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA1P52907 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPZA1P52907 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPZA1P52907 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPZA1P52907 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms