Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGDP52209 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGDP52209 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGDP52209 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGDP52209 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGDP52209 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGDP52209 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGDP52209 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGDP52209 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGDP52209 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGDP52209 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGDP52209 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGDP52209 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGDP52209 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGDP52209 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGDP52209 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGDP52209 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGDP52209 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGDP52209 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGDP52209 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGDP52209 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGDP52209 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGDP52209 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGDP52209 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGDP52209 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PGDP52209 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGDP52209 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGDP52209 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGDP52209 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGDP52209 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGDP52209 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGDP52209 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGDP52209 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGDP52209 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGDP52209 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGDP52209 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGDP52209 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGDP52209 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGDP52209 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGDP52209 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGDP52209 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGDP52209 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGDP52209 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGDP52209 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGDP52209 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGDP52209 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGDP52209 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGDP52209 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGDP52209 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PGDP52209 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGDP52209 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGDP52209 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGDP52209 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGDP52209 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGDP52209 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PGDP52209 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGDP52209 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGDP52209 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGDP52209 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGDP52209 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGDP52209 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGDP52209 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGDP52209 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGDP52209 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGDP52209 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGDP52209 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGDP52209 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGDP52209 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGDP52209 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGDP52209 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGDP52209 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGDP52209 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGDP52209 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGDP52209 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGDP52209 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGDP52209 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGDP52209 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGDP52209 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGDP52209 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGDP52209 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGDP52209 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGDP52209 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGDP52209 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms