Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HDGFP51858 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HDGFP51858 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HDGFP51858 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HDGFP51858 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HDGFP51858 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HDGFP51858 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HDGFP51858 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HDGFP51858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HDGFP51858 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HDGFP51858 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HDGFP51858 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFP51858 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFP51858 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFP51858 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFP51858 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFP51858 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFP51858 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFP51858 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFP51858 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFP51858 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFP51858 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HDGFP51858 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HDGFP51858 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HDGFP51858 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HDGFP51858 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HDGFP51858 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
HDGFP51858 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HDGFP51858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HDGFP51858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HDGFP51858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HDGFP51858 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HDGFP51858 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HDGFP51858 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HDGFP51858 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
HDGFP51858 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HDGFP51858 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HDGFP51858 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HDGFP51858 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HDGFP51858 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
HDGFP51858 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HDGFP51858 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HDGFP51858 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
HDGFP51858 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HDGFP51858 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HDGFP51858 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HDGFP51858 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HDGFP51858 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
HDGFP51858 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HDGFP51858 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HDGFP51858 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HDGFP51858 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HDGFP51858 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HDGFP51858 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
HDGFP51858 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HDGFP51858 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
HDGFP51858 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HDGFP51858 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
HDGFP51858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HDGFP51858 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HDGFP51858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HDGFP51858 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HDGFP51858 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HDGFP51858 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
HDGFP51858 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HDGFP51858 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
HDGFP51858 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HDGFP51858 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
HDGFP51858 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HDGFP51858 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HDGFP51858 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HDGFP51858 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
HDGFP51858 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HDGFP51858 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
HDGFP51858 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
HDGFP51858 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
HDGFP51858 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HDGFP51858 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HDGFP51858 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
HDGFP51858 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
HDGFP51858 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HDGFP51858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HDGFP51858 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HDGFP51858 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HDGFP51858 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HDGFP51858 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HDGFP51858 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HDGFP51858 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
HDGFP51858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HDGFP51858 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HDGFP51858 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HDGFP51858 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HDGFP51858 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HDGFP51858 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms