Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBP2P50120 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP2P50120 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP2P50120 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP2P50120 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBP2P50120 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP2P50120 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP2P50120 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBP2P50120 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBP2P50120 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP2P50120 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBP2P50120 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBP2P50120 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP2P50120 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP2P50120 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBP2P50120 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP2P50120 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP2P50120 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBP2P50120 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP2P50120 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBP2P50120 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP2P50120 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP2P50120 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBP2P50120 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP2P50120 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP2P50120 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP2P50120 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP2P50120 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBP2P50120 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP2P50120 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBP2P50120 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP2P50120 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP2P50120 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBP2P50120 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP2P50120 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBP2P50120 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBP2P50120 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBP2P50120 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP2P50120 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP2P50120 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP2P50120 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP2P50120 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP2P50120 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP2P50120 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP2P50120 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP2P50120 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP2P50120 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP2P50120 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP2P50120 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP2P50120 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP2P50120 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP2P50120 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP2P50120 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP2P50120 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP2P50120 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP2P50120 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP2P50120 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP2P50120 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP2P50120 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP2P50120 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP2P50120 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBP2P50120 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 669.5 ms