Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRIM2P49643 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRIM2P49643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRIM2P49643 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRIM2P49643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRIM2P49643 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRIM2P49643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIM2P49643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms