Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A3P48764 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A3P48764 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A3P48764 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3P48764 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms