Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX2P48431 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX2P48431 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX2P48431 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX2P48431 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX2P48431 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX2P48431 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX2P48431 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX2P48431 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX2P48431 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX2P48431 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX2P48431 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX2P48431 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX2P48431 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX2P48431 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX2P48431 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX2P48431 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX2P48431 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX2P48431 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX2P48431 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX2P48431 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX2P48431 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX2P48431 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX2P48431 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX2P48431 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX2P48431 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX2P48431 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX2P48431 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX2P48431 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX2P48431 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX2P48431 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX2P48431 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX2P48431 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX2P48431 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX2P48431 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX2P48431 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX2P48431 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX2P48431 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX2P48431 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX2P48431 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX2P48431 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX2P48431 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX2P48431 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX2P48431 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX2P48431 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX2P48431 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX2P48431 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX2P48431 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX2P48431 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX2P48431 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX2P48431 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX2P48431 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX2P48431 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX2P48431 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX2P48431 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX2P48431 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX2P48431 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX2P48431 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX2P48431 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX2P48431 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX2P48431 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX2P48431 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX2P48431 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX2P48431 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX2P48431 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX2P48431 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX2P48431 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX2P48431 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX2P48431 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX2P48431 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX2P48431 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SOX2P48431 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms