Protein–RNA interactions for Protein: P47890

OR1G1, Olfactory receptor 1G1, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR1G1P47890 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OR1G1P47890 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
OR1G1P47890 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
OR1G1P47890 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OR1G1P47890 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OR1G1P47890 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OR1G1P47890 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms