Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YEL008WYEL008W 381 nt7.89□□□□□ -1.15
MDE1P47095 SNX3YOR357C 489 nt7.89□□□□□ -1.15
MDE1P47095 YPR126CYPR126C 309 nt7.89□□□□□ -1.15
MDE1P47095 RIM2YBR192W 1134 nt7.88□□□□□ -1.15
MDE1P47095 DPL1YDR294C 1770 nt7.88□□□□□ -1.15
MDE1P47095 SAC7YDR389W 1965 nt7.87□□□□□ -1.15
MDE1P47095 KEL3YPL263C 1956 nt7.86□□□□□ -1.15
MDE1P47095 SPS100YHR139C 981 nt7.86□□□□□ -1.15
MDE1P47095 snR31snR31 225 nt7.86□□□□□ -1.15
MDE1P47095 TVP23YDR084C 600 nt7.85□□□□□ -1.15
MDE1P47095 SNZ1YMR096W 894 nt7.85□□□□□ -1.15
MDE1P47095 ORT1YOR130C 879 nt7.85□□□□□ -1.15
MDE1P47095 YMR265CYMR265C 1386 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 CTI6YPL181W 1521 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 LEU4YNL104C 1860 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 ELO1YJL196C 933 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 MGM101YJR144W 810 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 MHF1YOL086W-A 273 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 HAP5YOR358W 729 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 snR4snR4 186 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 FRT1YOR324C 1809 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 ADE16YLR028C 1776 nt7.84□□□□□ -1.15
MDE1P47095 ENO2YHR174W 1314 nt7.83□□□□□ -1.16
MDE1P47095 STF1YDL130W-A 261 nt7.83□□□□□ -1.16
MDE1P47095 RPC31YNL151C 756 nt7.83□□□□□ -1.16
MDE1P47095 NPP2YEL016C 1482 nt7.82□□□□□ -1.16
MDE1P47095 INH1YDL181W 258 nt7.82□□□□□ -1.16
MDE1P47095 GUT1YHL032C 2130 nt7.82□□□□□ -1.16
MDE1P47095 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.81□□□□□ -1.16
MDE1P47095 OPI3YJR073C 621 nt7.81□□□□□ -1.16
MDE1P47095 ABZ2YMR289W 1125 nt7.81□□□□□ -1.16
MDE1P47095 HXT11YOL156W 1704 nt7.81□□□□□ -1.16
MDE1P47095 ECM10YEL030W 1935 nt7.8□□□□□ -1.16
MDE1P47095 AIM34YMR003W 597 nt7.8□□□□□ -1.16
MDE1P47095 PFS2YNL317W 1398 nt7.8□□□□□ -1.16
MDE1P47095 YIL177CYIL177C 5277 nt7.8□□□□□ -1.16
MDE1P47095 MLS1YNL117W 1665 nt7.79□□□□□ -1.16
MDE1P47095 AFG2YLR397C 2343 nt7.79□□□□□ -1.16
MDE1P47095 TRP2YER090W 1524 nt7.79□□□□□ -1.16
MDE1P47095 POT1YIL160C 1254 nt7.79□□□□□ -1.16
MDE1P47095 NAS6YGR232W 687 nt7.78□□□□□ -1.16
MDE1P47095 STE4YOR212W 1272 nt7.78□□□□□ -1.16
MDE1P47095 AMF1YOR378W 1548 nt7.78□□□□□ -1.16
MDE1P47095 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
MDE1P47095 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
MDE1P47095 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.76□□□□□ -1.17
MDE1P47095 SRM1YGL097W 1449 nt7.76□□□□□ -1.17
MDE1P47095 HSV2YGR223C 1347 nt7.76□□□□□ -1.17
MDE1P47095 TOP3YLR234W 1971 nt7.75□□□□□ -1.17
MDE1P47095 ITR1YDR497C 1755 nt7.74□□□□□ -1.17
MDE1P47095 SUV3YPL029W 2214 nt7.74□□□□□ -1.17
MDE1P47095 CPD1YGR247W 720 nt7.74□□□□□ -1.17
MDE1P47095 GSF2YML048W 1212 nt7.73□□□□□ -1.17
MDE1P47095 YDR467CYDR467C 327 nt7.72□□□□□ -1.17
MDE1P47095 KRE1YNL322C 942 nt7.72□□□□□ -1.17
MDE1P47095 NDE1YMR145C 1683 nt7.72□□□□□ -1.17
MDE1P47095 FTH1YBR207W 1398 nt7.71□□□□□ -1.17
MDE1P47095 SWT21YNL187W 1074 nt7.71□□□□□ -1.18
MDE1P47095 CRC1YOR100C 984 nt7.71□□□□□ -1.18
MDE1P47095 LEU2YCL018W 1095 nt7.71□□□□□ -1.18
MDE1P47095 GGC1YDL198C 903 nt7.7□□□□□ -1.18
MDE1P47095 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.7□□□□□ -1.18
MDE1P47095 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.7□□□□□ -1.18
MDE1P47095 MET1YKR069W 1782 nt7.69□□□□□ -1.18
MDE1P47095 PRC1YMR297W 1599 nt7.69□□□□□ -1.18
MDE1P47095 CTF3YLR381W 2202 nt7.68□□□□□ -1.18
MDE1P47095 CHA1YCL064C 1083 nt7.68□□□□□ -1.18
MDE1P47095 TPC1YGR096W 945 nt7.67□□□□□ -1.18
MDE1P47095 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
MDE1P47095 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
MDE1P47095 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.67□□□□□ -1.18
MDE1P47095 SLM3YDL033C 1254 nt7.66□□□□□ -1.18
MDE1P47095 YLR349WYLR349W 507 nt7.66□□□□□ -1.18
MDE1P47095 ADH7YCR105W 1086 nt7.65□□□□□ -1.18
MDE1P47095 SBP1YHL034C 885 nt7.65□□□□□ -1.18
MDE1P47095 TUB4YLR212C 1422 nt7.65□□□□□ -1.18
MDE1P47095 MDH2YOL126C 1134 nt7.65□□□□□ -1.18
MDE1P47095 CCR4YAL021C 2514 nt7.64□□□□□ -1.19
MDE1P47095 DIA4YHR011W 1341 nt7.64□□□□□ -1.19
MDE1P47095 PMT7YDR307W 1989 nt7.64□□□□□ -1.19
MDE1P47095 BEM1YBR200W 1656 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 KGD2YDR148C 1392 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YKL053WYKL053W 375 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 GPM1YKL152C 744 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YBL095WYBL095W 813 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YLR072WYLR072W 2082 nt7.63□□□□□ -1.19
MDE1P47095 GGA2YHR108W 1758 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 SPE2YOL052C 1191 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YMC2YBR104W 990 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YIL108WYIL108W 2091 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 SRP54YPR088C 1626 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 NAM8YHR086W 1572 nt7.62□□□□□ -1.19
MDE1P47095 PAU15YIR041W 375 nt7.61□□□□□ -1.19
MDE1P47095 EMC3YKL207W 762 nt7.61□□□□□ -1.19
MDE1P47095 FSH2YMR222C 672 nt7.6□□□□□ -1.19
MDE1P47095 REX2YLR059C 810 nt7.59□□□□□ -1.19
MDE1P47095 YPT11YNL304W 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
MDE1P47095 SAN1YDR143C 1833 nt7.57□□□□□ -1.2
MDE1P47095 PAR32YDL173W 888 nt7.57□□□□□ -1.2
MDE1P47095 NIF3YGL221C 867 nt7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms