Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOP2P46087 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOP2P46087 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP2P46087 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NOP2P46087 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP2P46087 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP2P46087 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOP2P46087 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP2P46087 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP2P46087 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP2P46087 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP2P46087 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOP2P46087 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP2P46087 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOP2P46087 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOP2P46087 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOP2P46087 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOP2P46087 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOP2P46087 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP2P46087 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP2P46087 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOP2P46087 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP2P46087 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP2P46087 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOP2P46087 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOP2P46087 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOP2P46087 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOP2P46087 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOP2P46087 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP2P46087 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOP2P46087 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOP2P46087 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP2P46087 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOP2P46087 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOP2P46087 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP2P46087 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP2P46087 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP2P46087 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP2P46087 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOP2P46087 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOP2P46087 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOP2P46087 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP2P46087 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP2P46087 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOP2P46087 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP2P46087 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP2P46087 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP2P46087 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP2P46087 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP2P46087 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP2P46087 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP2P46087 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP2P46087 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP2P46087 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP2P46087 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP2P46087 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP2P46087 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP2P46087 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP2P46087 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP2P46087 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP2P46087 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP2P46087 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP2P46087 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP2P46087 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP2P46087 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP2P46087 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP2P46087 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP2P46087 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP2P46087 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP2P46087 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP2P46087 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP2P46087 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP2P46087 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP2P46087 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NOP2P46087 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP2P46087 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP2P46087 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP2P46087 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NOP2P46087 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP2P46087 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NOP2P46087 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP2P46087 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms