Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSFMP43897 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSFMP43897 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSFMP43897 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSFMP43897 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSFMP43897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSFMP43897 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSFMP43897 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSFMP43897 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSFMP43897 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSFMP43897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSFMP43897 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSFMP43897 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSFMP43897 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSFMP43897 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSFMP43897 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSFMP43897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSFMP43897 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSFMP43897 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSFMP43897 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSFMP43897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSFMP43897 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSFMP43897 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSFMP43897 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSFMP43897 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSFMP43897 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSFMP43897 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSFMP43897 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSFMP43897 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSFMP43897 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSFMP43897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSFMP43897 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSFMP43897 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSFMP43897 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSFMP43897 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSFMP43897 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSFMP43897 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSFMP43897 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TSFMP43897 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSFMP43897 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSFMP43897 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSFMP43897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSFMP43897 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSFMP43897 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSFMP43897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSFMP43897 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSFMP43897 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSFMP43897 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSFMP43897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSFMP43897 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSFMP43897 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSFMP43897 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSFMP43897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSFMP43897 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSFMP43897 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSFMP43897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSFMP43897 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSFMP43897 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSFMP43897 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSFMP43897 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSFMP43897 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSFMP43897 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSFMP43897 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSFMP43897 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSFMP43897 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSFMP43897 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSFMP43897 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSFMP43897 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSFMP43897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSFMP43897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSFMP43897 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSFMP43897 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSFMP43897 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSFMP43897 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSFMP43897 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSFMP43897 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSFMP43897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSFMP43897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSFMP43897 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSFMP43897 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSFMP43897 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSFMP43897 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSFMP43897 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSFMP43897 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSFMP43897 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSFMP43897 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSFMP43897 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSFMP43897 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSFMP43897 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSFMP43897 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSFMP43897 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSFMP43897 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSFMP43897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSFMP43897 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSFMP43897 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms